Với những thành tích xuất sắc trong quá trình xây dựng, phát triển và phục vụ đất nước, Trường Đại học Dược Hà Nội đã được Đảng và Nhà nước trao tặng nhiều phần thưởng cao quý:                         

       - Huân chương Độc lập hạng nhì ( 2012)

- Anh hùng lao động ( 2011)

       - Huân chương Độc lập hạng ba (2006)

       - Huân chương Lao động hạng Nhất (2001)

       - Huân chương Lao động hạng Nhì (1996)

        - Huân chương Lao động hạng Ba (1975 cho Trường, 2008 cho Công đoàn Trường)

        - Huân chương Kháng chiến hạng Ba (1973)

        - Huân chương Tự do hạng Nhất của CHDCND Lào (1983

Nhà trường tiếp tục phấn đấu nhiều hơn nữa để xứng đáng là một trường đại học trọng điểm quốc gia, một trung tâm khoa học và đào tạo nguồn nhân lực dược có chất lượng cao của ngành y tế.